报考人群不同（在职研究生报考人群大多为已经参加工作的职场人士，全日制研究生大多为应届本科毕业生）；学习形式不同（在职研究生采取的是半脱产学习形式，全日制研究生则是全脱产学习）；学制、学费不同（在学制方面，同等学力申硕学制为2年，非全日制学制为2-3年，全日制学制为3年）。
全日制研究生是先参加全国统一的研究生入学考试，考试通过之后参加学校组织的复试，经录取入学学习，竞争强度比较大;在职研究生是免试入学，经学校资格审核进行录取工作，入学难度相对较低。此外，在职研究生对大专学历报读者也没有过多限制，也无需加试等，为更广泛的人群提供了深造学习机会。
在职研究生和全日制研究生含金量在职研究生和全日制研究生含金量一样，主要体现在两个方面。1、在职研究生和全日制一样都是国家计划内招生，课程具备同等质量，只是学习方式不同；2、在职研究生不同方式获证情况不同，但所获硕士学位证书或研究生学历证书受国家承认，其社会认可度和含金量与全日制证书相同。
